近期,江南大學生物工程學院徐巖教授團隊吳群教授課題組在發(fā)酵食品微生物方面取得重要進展,研究成果“metagenomics reveals the habitat specificity of biosynthetic potential of secondary metabolites in global food fermentations”正式發(fā)表于Microbiome(Q1,IF: 16.837)。Microbiome是微生物領域的國際權威期刊,在微生物領域中排名6/158 (期刊引用指數(shù)JCI)。
文章鏈接:https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-023-01536-8
發(fā)酵食品被認為是對人類健康有益的。微生物通過生物合成基因簇(BGCs)代謝產(chǎn)生多種多樣的次級代謝產(chǎn)物,這些產(chǎn)物通常具有寶貴的生物活性。然而,全球食品發(fā)酵中微生物次級代謝潛力的多樣性和分布仍然未知。
文章通過宏基因組學分析對全球食品發(fā)酵中的BGCs進行了大規(guī)模綜合調(diào)查。在本研究中,作者收集了全球15種常見發(fā)酵食品的367個宏基因組測序數(shù)據(jù)。通過宏基因組分箱技術,獲得了653個細菌宏基因組組裝基因組(MAGs)。在這些MAGs中識別出2334個次級代謝物BGCs,包括1003個新的BGCs,Bacillaceae,Streptococcaceae,Streptomycetaceae,Brevibacteriaceae和Lactobacillaceae含有高豐度的新BGCs(≥60個新BGCs)。在2334個BGCs中,1655個是棲息地特異性的。80.54%的棲息地特異性BGC源自于棲息地特異性物種。生物活性預測分析表明,183個BGC產(chǎn)生的次級代謝物具有高概率的抗菌活性(>80%)。這183個BGC分布在所有15種食品發(fā)酵類型中,其中奶酪發(fā)酵中含有最多的BGC數(shù)量,其次是豆瓣醬和白酒發(fā)酵。本研究證明了食品發(fā)酵系統(tǒng)是一個未開發(fā)的BGC資源,儲備了豐富的、具有生物活性的次級代謝產(chǎn)物。同時,該研究為發(fā)酵食品潛在的人類健康益處提供了新見解。
吳群教授為論文的通訊作者,我校2019級博士生杜如冰為第一作者。上述研究得到了國家自然科學基金(32172175)等項目資助。