近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料所芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功構(gòu)建了五個(gè)高質(zhì)量的染色體水平的芝麻參考基因組,并在全基因組水平鑒定了芝麻自然群體結(jié)構(gòu)變異,發(fā)現(xiàn)了調(diào)控芝麻株型和產(chǎn)量性狀的候選基因,揭示了芝麻株型和產(chǎn)量相關(guān)性狀變異的分子基礎(chǔ)。該項(xiàng)研究成果發(fā)表在國際知名學(xué)術(shù)刊物《植物生物技術(shù)(Plant Biotechnology Journal)》上。
該團(tuán)隊(duì)首席、文章通訊作者王林海研究員介紹,該研究通過整合二代、三代測序數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)了五個(gè)代表性芝麻品種基因組的從頭組裝,為芝麻研究提供了五個(gè)高質(zhì)量的參考基因組,結(jié)合214份芝麻種質(zhì)的自然群體重測序分析,發(fā)現(xiàn)了與芝麻株型和產(chǎn)量性狀相關(guān)的結(jié)構(gòu)變異,并發(fā)掘出兩個(gè)能同時(shí)調(diào)控芝麻分枝和每葉腋蒴果數(shù)的多效性候選基因,為分析芝麻基因組結(jié)構(gòu)和進(jìn)化、重要性狀基因發(fā)掘與等位基因鑒定提供了寶貴的基因組資源和有效的方法。
上述研究得到了中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國家特色油料產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。該團(tuán)隊(duì)出站博士后宋勝楠、在站博士后法蘭克(Senouwa Segla Koffi Dossou)和華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士研究生孟明輝為論文共同第一作者,王林海研究員和游均副研究員為共同通訊作者。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/pbi.14092