近年來，中國水科院以強化國家漁業科技戰略力量為主線，堅持創新是引領發展的第一動力，把科技創新作為立院立所的根本，著力深化“學科、團隊、項目、平臺、成果”一體化發展，強化原始創新、突破技術瓶頸，高水平科研論文產出不斷再上新臺階。   　　根據2023年1月13日最新發布的“ESI學科排名數據”，中國水科院4個學科進入全球前1%排行榜，相比2019年初發布的數據，上榜學科由1個學科上升為4個學科。其中，植物與動物科學排名上升195位，環境與生態學、生物學與生物化學、農業科學分別于2020年、2022年、2023年先后上榜，論文數量和影響力均有提升。全院全球前1%高被引論文集中在水產養殖技術和水產生物技術與育種領域，主要來自院黃海水產研究所、南海水產研究所、黑龍江水產研究所、珠江水產研究所、淡水漁業研究中心、漁業機械儀器研究所等單位。   　　ESI是美國科睿唯安發布《基本科學指標數據庫》（Essential Science Indicators）的英文縮寫，是基于Web of Science（SCIE/SSCI）所收錄的全球12000多種學術期刊的1000多萬條文獻記錄而建立的計量分析數據庫。目前，ESI已成為當今世界范圍內普遍用以評價高校、學術機構、國家/地區的國際學術水平及影響力的重要評價指標工具之一，也是全球公認的判斷學科發展水平的重要參照之一。ESI將全部科學分為22個專業領域，依據最近10年的高影響力論文數據，定期評選進入相應學科全球前1%的機構。