2022年3月18日,國際著名學(xué)術(shù)期刊《Nature Communications》在線發(fā)表了題為《Structures of a deltacoronavirus spike protein bound to porcine and human receptors》(豬德爾塔冠狀病毒刺突蛋白與人和豬受體復(fù)合物的結(jié)構(gòu))的研究論文。報道了江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)所李彬研究員團(tuán)隊與南京農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院張水軍教授合作在豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV)跨物種傳播方面的重要研究成果。
冠狀病毒的跨種傳播對全球公共衛(wèi)生構(gòu)成了重大威脅,冠狀病毒屬的很多成員可以跨物種感染人和動物,包括新型冠狀病毒SARS-CoV-2、SARS冠狀病毒和中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)等。
豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV)是一種新型豬腸道冠狀病毒,可引起哺乳仔豬腹瀉和嘔吐,生長豬、成年豬及生產(chǎn)母豬也可感染,給全球養(yǎng)豬業(yè)帶來巨大經(jīng)濟(jì)損失。該病毒于2012年首次在香港的豬群中發(fā)現(xiàn),2014年2月美國在腹瀉仔豬和母豬的糞便中首次檢測到PDCoV。隨后,韓國和中國大陸也從腹瀉豬的臨床樣品中檢測到該病毒。
2021年12月,據(jù)《Nature》期刊報道,從海地的三名發(fā)熱兒童血清樣本中檢測并分離到了PDCoV,表明PDCoV具有感染人的風(fēng)險。冠狀病毒通過其表面的刺突蛋白與細(xì)胞受體結(jié)合,入侵宿主細(xì)胞從而實現(xiàn)感染。然而,PDCoV結(jié)合受體的分子機(jī)制仍不明確,研究其與人和豬的受體分子結(jié)合是揭示其跨種傳播的關(guān)鍵。
研究團(tuán)隊解析了PDCoV的刺突蛋白(S蛋白)受體結(jié)合區(qū)(RBD)與人和豬的細(xì)胞受體氨基肽酶N(APN)的復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu),揭示了PDCoV結(jié)合兩個物種受體上保守的氨基酸位點,且發(fā)現(xiàn)PDCoV的RBD在人和豬APN上具有高度相似的結(jié)合區(qū)域,可能是其感染豬和人的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。但該結(jié)合區(qū)域與人冠狀病毒HCoV-229E、豬呼吸道冠狀病毒(PRCoV)與受體APN的結(jié)合區(qū)域完全不同。
結(jié)合體外生化和病毒感染實驗,研究團(tuán)隊進(jìn)一步鑒定了APN受體上影響PDCoV實現(xiàn)跨物種傳播的關(guān)鍵氨基酸位點(Y316、K379、E426和W429)。該論文揭示了豬德爾塔冠狀病毒跨物種傳播的可能機(jī)制,為研制該病毒的疫苗和藥物提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和理論依據(jù)。
獸醫(yī)所李彬研究員、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)生科院張水軍教授、徐穎副教授為論文的共同通訊作者。獸醫(yī)所博士后彭棋和南農(nóng)博士研究生紀(jì)蔚偉為論文的共同第一作者。我院中心實驗室徐寸發(fā)老師也參與了相關(guān)實驗。該研究得到了十四五國家重點研發(fā)計劃、江蘇省杰出青年基金、省部共建重點實驗室重大自主課題、江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金等項目的資助。
參考文獻(xiàn):
1. Lednicky, J.A., Tagliamonte, M.S., White, S.K., Elbadry, M.A., Alam, M.M., Stephenson, C.J., et al. (2021)。 Independent infections of porcine deltacoronavirus among Haitian children. Nature 600(7887), 133-137. doi: 10.1038/s41586-021-04111-z.
2. 論文鏈接:https://www.nature.com/articles/ s41467-022-29062-5