近日,上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院周培教授團(tuán)隊(duì)在生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域國(guó)際著名期刊Journal of Hazardous Materials(中科院一區(qū) Top)在線發(fā)表了題為Comparative cytology combined with transcriptomic and metabolomic analyses of Solanum nigrum L. in response to Cd toxicity的研究論文。研究利用植物細(xì)胞學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)方法分析超富集植物龍葵對(duì)短期不同濃度鎘(Cd)脅迫的響應(yīng)變化,探討了龍葵對(duì)Cd脅迫的應(yīng)對(duì)機(jī)制。該研究結(jié)果為Cd脅迫相關(guān)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控提供新視野,從而為生態(tài)環(huán)境中重金屬污染植物修復(fù)技術(shù)應(yīng)用提供了重要借鑒。
土壤Cd污染是一個(gè)嚴(yán)重的全球性生態(tài)環(huán)境問題,中國(guó)、日本、歐美等國(guó)家的耕地都存在不同程度的Cd污染現(xiàn)象。土壤Cd污染植物修復(fù)技術(shù)因具有環(huán)境友好、成本低廉、操作簡(jiǎn)便、視覺美觀等優(yōu)點(diǎn)被公眾所關(guān)注,而超富集植物龍葵常被用于Cd污染土壤修復(fù)。課題組前期研究發(fā)現(xiàn)Cd脅迫下龍葵通過調(diào)節(jié)體內(nèi)抗氧化酶活、細(xì)胞壁多糖組分、Cd的亞細(xì)胞分布及賦存化學(xué)形態(tài)來抵御Cd毒害(https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2019.109997; https://doi.org/10.1007/s11356-020-11505-5)。然而,龍葵對(duì)Cd的高耐受性及解毒分子機(jī)制尚不清晰。因此,需要結(jié)合多組學(xué)技術(shù)研究龍葵對(duì)Cd脅迫的應(yīng)答機(jī)制。
該論文研究采用水培試驗(yàn)對(duì)龍葵進(jìn)行不同濃度Cd脅迫處理,重點(diǎn)研究了Cd脅迫下,龍葵各器官(根、莖、葉)細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)變化,并對(duì)根組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)與代謝組學(xué)聯(lián)合分析。通過透射電鏡(TEM)發(fā)現(xiàn),Cd脅迫嚴(yán)重破壞了龍葵各器官細(xì)胞超微結(jié)構(gòu),且受損程度與Cd脅迫濃度呈濃度-劑量效應(yīng)。此外,龍葵各器官細(xì)胞采取增厚細(xì)胞壁、將胞內(nèi)Cd2+轉(zhuǎn)運(yùn)至液泡等方式進(jìn)行解毒。
隨后,對(duì)龍葵根系進(jìn)行代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。代謝組學(xué)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)Cd脅迫下龍葵根系有7條代謝通路被顯著干擾,涉及19個(gè)差異表達(dá)代謝物(DEMs)。而轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析結(jié)果鑒定出3908個(gè)共同差異表達(dá)基因(DEGs),其中上調(diào)DEGs 1049個(gè),下調(diào)DEGs 2859個(gè)。除此之外,該研究利用組學(xué)聯(lián)合分析還發(fā)現(xiàn)了Cd脅迫下參與根組織細(xì)胞壁生物合成的DEMs和DEGs,初步揭示了細(xì)胞壁在龍葵根系解毒Cd過程中發(fā)揮的重要作用。
上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院生態(tài)學(xué)博士生王軍才為論文第一作者, 周培教授為通訊作者, 博士后初少華、張丹副研究員等參與了該研究。課題組多年來一直從事農(nóng)業(yè)產(chǎn)地環(huán)境污染防治與修復(fù)方面的研究,并在Journal of Hazardous Materials、Environmental Pollution、Bioresource Technology、Science of The Total Environment等國(guó)內(nèi)外權(quán)威期刊發(fā)表多篇論文。相關(guān)研究得到國(guó)家重大研發(fā)計(jì)劃和國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目支持。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2021.127168