小麥(Triticum aestivum L.)是重要的糧食作物之一,隨著世界人口增多、耕地面積減少以及氣候變化,提升小麥產(chǎn)量是育種的重要目標(biāo)。小麥穗主要由附著于穗軸兩側(cè)交替互生的小穗構(gòu)成。小穗進一步分化成數(shù)目不定的小花,其中3-5朵小花能最終形成籽粒。因此,小麥穗型的發(fā)育與籽粒產(chǎn)量密切相關(guān)。挖掘小麥穗型發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控基因,解析其作用的分子網(wǎng)絡(luò),對于通過分子設(shè)計優(yōu)化穗型,提高小麥產(chǎn)量潛力具有重要的理論意義與應(yīng)用價值。
穗發(fā)育突變體是探究小麥穗型調(diào)控機制的優(yōu)異材料。超數(shù)小穗(supernumerary spikelets)是一種在一個穗節(jié)點著生額外小穗的穗型變異,主要包括四種類型,分別為分枝穗、多棱穗、平行小穗及復(fù)生小穗(Paired spikelet,PS)。該研究在自育小麥品種科成麥1號(K1)的EMS誘變?nèi)后w中發(fā)現(xiàn)了一個具有復(fù)生小穗表型的突變體,其特點為在一個穗節(jié)處著生兩個小穗,命名為wps1(wheat paired spikelets 1)。表型鑒定結(jié)果顯示,該突變體的可育小穗數(shù)和穗粒數(shù)均顯著高于野生型。研究通過幼穗觀察發(fā)現(xiàn),wps1次小穗的發(fā)育晚于主小穗,花序分生組織的活性可能發(fā)生變化。
遺傳分析表明,wps1中復(fù)生小穗表型受到一個顯性核基因控制,命名為WPS1(WHEAT PAIRED SPIKELET 1)。研究利用BSR分析法,結(jié)合分子標(biāo)記技術(shù)構(gòu)建遺傳連鎖圖譜和物理圖譜,將WPS1定位在1D染色體208.18~220.92Mb之間。該位點附近尚無穗發(fā)育相關(guān)基因報道,是一個新的基因位點。研究利用“中國春”參考基因組序列及重測序數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),對該區(qū)間內(nèi)的基因變異及表達水平進行分析,最終鎖定一個候選基因TraesCS1D02G155200。在wps1中,該基因發(fā)生一個非同義突變,且表達量顯著升高。TraesCS1D02G155200編碼一個HD-ZIP Ⅲ家族的轉(zhuǎn)錄因子,與擬南芥REV和水稻OsHB2同源,具有一段與miRNA165/166結(jié)合的序列。wps1中該基因的變異恰好處于與miRNA165/166結(jié)合的區(qū)域內(nèi)。因此,研究推測,wps1中該位點突變,阻礙了miRNA165/166與TraesCS1D02G155200轉(zhuǎn)錄本的結(jié)合和降解,導(dǎo)致表達量提高,進而產(chǎn)生復(fù)生小穗表型。
為初步解析wps1中復(fù)生小穗形成的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),研究對K1和wps1的幼穗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行挖掘,結(jié)果發(fā)現(xiàn)生長素合成、穩(wěn)態(tài)維持和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因在wps1中表達量顯著上調(diào),暗示復(fù)生小穗表型的發(fā)生可能受到生長素信號的調(diào)控。以往研究報道了Ppd-1(Photoperiod-1)、TB1(Teosinte Branched 1)能夠通過調(diào)控開花基因FT(FLOWERING LOCUS T)進而影響下游基因VRN1(VERNALIZATION 1)的表達,從而影響開花和復(fù)生小穗表型的發(fā)生。擬南芥中的節(jié)律基因LHY(LATE ELonGATED HYPOCOTYL)能夠通過調(diào)控FT1的表達影響開花。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,在突變體中,Ppd-1、FT1、VRN1及LHY的表達量下調(diào),TB1表達量上調(diào),這與前人報道一致,表明上述基因或共同參與wps1中復(fù)生小穗的形成。
本研究鑒定到一個新的控制小麥穗發(fā)育的基因位點及其候選基因,為后續(xù)基因克隆、功能驗證及分子機制研究奠定了基礎(chǔ)。近日,相關(guān)研究成果以Genetic and transcriptomic dissection of an artificially induced paired spikelets mutant of wheat (Triticum aestivum L.)為題,在線發(fā)表在Theoretical and Applied Genetics上。研究工作得到四川省重點研發(fā)計劃、四川省作物育種攻關(guān)項目和國家重點研發(fā)計劃的支持。