近日，國際知名雜志Emerging Microbes & Infections（IF=19.568）發表了畜牧獸醫所聯合山東第一醫科大學等單位合作研究成果：Identification of a recombinant equine coronavirus in donkey, China。該研究首次在我國驢群中發現馬冠狀病毒（ECoV），研究人員獲得了病毒全基因組序列并進行了生物信息學分析，為ECoV跨宿主感染驢和在馬屬動物中監測ECoV提供了證據及理論依據。畜牧獸醫所為第一產權單位，草食動物疫病防控創新團隊齊鵬飛為第一作者，張偉和山東第一醫科大學史衛峰為本文共同通訊作者。   　　ECoV和SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV均是β冠狀病毒屬成員，其中ECoV屬于Embecovirus亞屬。本研究基于RT-qPCR從兩例腹瀉驢駒的小腸樣本中檢測出ECoV，通過細胞培養及電鏡觀察發現樣本中存在典型的CoV病毒顆粒（圖1）。研究人員對兩例陽性樣本進行高通量測序，通過序列組裝和比對獲得了兩條ECoV全基因組序列。序列分析表明，新發現的兩株ECoV基因組序列完全一致，與數據庫中的ECoV比對發現相似性最高的是ECoV NC99（圖2）。對ECoV新毒株和代表毒株進行系統發育分析表明，盡管新毒株和已知ECoV位于同一個大的分支，但又存在明顯的區分（圖3）。進一步的重組分析發現該毒株NS2基因附近存在重組現象，推測為新型重組突變株，這是我國科研人員首次在國內驢群中發現分離鑒定出ECoV。該研究得到山東省現代農業產業技術體系、山東省農業科學院創新工程和山東第一醫科大學學術提升計劃等項目的資助。   　　（文章鏈接：https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2022.2056522）