近日，國際知名雜志Emerging Microbes & Infections（IF=19.568）發(fā)表了畜牧獸醫(yī)所聯(lián)合山東第一醫(yī)科大學(xué)等單位合作研究成果：Identification of a recombinant equine coronavirus in donkey, China。該研究首次在我國驢群中發(fā)現(xiàn)馬冠狀病毒（ECoV），研究人員獲得了病毒全基因組序列并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析，為ECoV跨宿主感染驢和在馬屬動物中監(jiān)測ECoV提供了證據(jù)及理論依據(jù)。畜牧獸醫(yī)所為第一產(chǎn)權(quán)單位，草食動物疫病防控創(chuàng)新團隊齊鵬飛為第一作者，張偉和山東第一醫(yī)科大學(xué)史衛(wèi)峰為本文共同通訊作者。   　　ECoV和SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV均是β冠狀病毒屬成員，其中ECoV屬于Embecovirus亞屬。本研究基于RT-qPCR從兩例腹瀉驢駒的小腸樣本中檢測出ECoV，通過細(xì)胞培養(yǎng)及電鏡觀察發(fā)現(xiàn)樣本中存在典型的CoV病毒顆粒（圖1）。研究人員對兩例陽性樣本進(jìn)行高通量測序，通過序列組裝和比對獲得了兩條ECoV全基因組序列。序列分析表明，新發(fā)現(xiàn)的兩株ECoV基因組序列完全一致，與數(shù)據(jù)庫中的ECoV比對發(fā)現(xiàn)相似性最高的是ECoV NC99（圖2）。對ECoV新毒株和代表毒株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析表明，盡管新毒株和已知ECoV位于同一個大的分支，但又存在明顯的區(qū)分（圖3）。進(jìn)一步的重組分析發(fā)現(xiàn)該毒株NS2基因附近存在重組現(xiàn)象，推測為新型重組突變株，這是我國科研人員首次在國內(nèi)驢群中發(fā)現(xiàn)分離鑒定出ECoV。該研究得到山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程和山東第一醫(yī)科大學(xué)學(xué)術(shù)提升計劃等項目的資助。   　　（文章鏈接：https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2022.2056522）