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中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水中心在淡水螺類遺傳與苗種繁育研究方面取得新進(jìn)展

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2022-07-24 00:06:25    來(lái)源:云推B2B網(wǎng)    作者:云推小編    瀏覽次數(shù):804    評(píng)論:0
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近日,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、淡水漁業(yè)研究中心“長(zhǎng)江特色水生動(dòng)物繁養(yǎng)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”在淡水螺類遺傳與苗種繁育研究方面取得新進(jìn)展。

  近日,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、淡水漁業(yè)研究中心“長(zhǎng)江特色水生動(dòng)物繁養(yǎng)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”在淡水螺類遺傳與苗種繁育研究方面取得新進(jìn)展。     梨形環(huán)棱螺(B. purificata)俗稱螺螄、石螺、豆田螺、湖螺,是環(huán)棱螺屬中個(gè)體最大的種,具有分布廣、用途多的優(yōu)點(diǎn),既是中華絨螯蟹、中華鱉、青魚等優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)品的重要天然餌料,也是特色水產(chǎn)品寬體金線蛭的唯一餌料來(lái)源,更是廣大市民“菜籃子”工程的重要組成部分之一。作為柳州螺螄粉重要原料之一,梨形環(huán)棱螺的短缺一定程度上也限制了地方特色產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展。此外,在淡水水域生態(tài)系統(tǒng)中,梨形環(huán)棱螺對(duì)維持淡水水生態(tài)系統(tǒng)平衡同樣具有不可替代的作用。     自2015年起,團(tuán)隊(duì)圍繞梨形環(huán)棱螺群體遺傳學(xué)、選擇育種、池塘一級(jí)凈化區(qū)不投餌養(yǎng)殖和“稻螺共作”等生產(chǎn)方式及水產(chǎn)品加工領(lǐng)域開展了系列研究,為梨形環(huán)棱螺規(guī)模化繁養(yǎng)積累了一系列解決方案。     為了進(jìn)一步挖掘梨形環(huán)棱螺種質(zhì)資源,團(tuán)隊(duì)通過(guò)PacBio測(cè)序和Hi-C技術(shù)組裝獲得了首個(gè)梨形環(huán)棱螺染色體水平基因組,共產(chǎn)生了33.64Gb的環(huán)形一致性序列。初步組裝的梨形環(huán)棱螺基因組大小為1.01Gb,Contig N50長(zhǎng)45.14Mb。通過(guò)Hi-C技術(shù)的糾錯(cuò),最終得到984.33Mb大小的梨形環(huán)棱螺基因組,Contig N50長(zhǎng)37.21Mb,scaffold N50長(zhǎng)141.97 Mb,并將99.28%的基因組序列錨定到8條染色體上,共預(yù)測(cè)了22125個(gè)蛋白編碼基因。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明:梨形環(huán)棱螺與福壽螺大約在2.88億年前產(chǎn)生分化;比較基因組分析表明:梨形環(huán)棱螺中有34個(gè)基因家族發(fā)生擴(kuò)張,26個(gè)基因家族發(fā)生收縮,4個(gè)蛋白編碼的基因被正選擇(FDR<0.05)。該研究為進(jìn)一步探究淡水螺類的生態(tài)學(xué)、進(jìn)化及選擇育種提供了重要的基因組資源。     相關(guān)研究論文“Chromosome-level genome assembly of the freshwater snail Bellamya purificata (Caenogastropoda)”在線發(fā)表于JCR一區(qū)期刊《Zoological Research》(IF=6.975)上。淡水中心水產(chǎn)養(yǎng)殖研究室金武博士、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院曹小娟副教授為共同第一作者,徐東坡研究員和聞海波研究員為共同通訊作者。全文網(wǎng)址:https://www.zoores.ac.cn/en/article/doi/10.24272/j.issn.2095-8137.2022.118     本研究得到了水科院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)(2021XT703)和淡水中心基本業(yè)務(wù)費(fèi)(2021JBFM07)資助。     (院長(zhǎng)江特色水生動(dòng)物繁養(yǎng)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、水產(chǎn)養(yǎng)殖研究室、水生生物資源研究室 供稿)
 
(文/云推小編)
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